El conjunto chileno Unión Española finalizó en primer lugar del Grupo Dos, con nueve Puntos, y El Ciclón e Independiente del Valle, de Ecuador, con ocho unidades, y Los Cuervos avanzaron a octavos de final por mejor diferencia de goles, de apenas más uno, por cero del cuadro ecuatoriano.
En octavos de final se le presentó otro obstáculo brasileño, el Gremio, al que derrotó en casa por 1-0, pero perdió de visita por el mismo marcador y entonces en tanda de penales avanzó por marcador de 4-2.
Posteriormente, en cuartos de final derrotó a Cruzeiro por 1-0 y de visita igualó 1-1 para superar un poco el sufrimiento de los penales, y en semifinales se dio un festín de 5-0 ante el visitante Bolívar, cuadro que se conformó con ganar en casa por 1-0.
Llegó el 6 de agosto, día del primer partido de la final inédita, en la cancha del estadio Defensores del Chaco, de Asunción, Paraguay, la casa de Nacional, donde Mauro Matosas adelantó a los también llamados Santos y en el 93 marcó la igualada Julio Santa Cruz.
Siete días después se desarrolló el encuentro de vuelta, en el estadio Nuevo Gasómetro, de Buenos Aires, donde el paraguayo nacido en Argentina, Néstor Ortigoza marcó de penal al minuto 36 el gol que le dio la primera Copa Libertadores de América a San Lorenzo de Almagro.
El 20 de agosto visitó una comitiva integrada por el presidente Matías Lammens, el vicepresidente Marcelo Tinelli, el técnico Edgardo Bauza y algunos jugadores al Papa Francisco en El Vaticano, le obsequiaron una playera y una réplica del trofeo.
“De modo especial saludo a los Campeones de América, el equipo de San Lorenzo, acá presente, y que es parte de mi identidad cultural”, expresó en su audiencia el Papa.
De ahí a la Copa Mundial de Clubes Marruecos 2014, donde en semifinales derrotó 2-1 al Auckland City y en la final cayó 2-0 ante Real Madrid para un digno subcampeonato.
