MÉXICO, D.F.- Fragoso vistió las plumas americanistas a partir del año 1962, etapa en la que debutó en el máximo circuito mexicano. El también llamado «Chalo» fue partícipe del primer título de las Águilas, en la temporada 1965-66.
Asimismo, Javier Fragoso formó parte de la Selección Nacional de México, donde disputó dos copas mundiales (Inglaterra 66 y México 70). Incluso, el entonces jugador americanista dio la estocada final en el 2-1 del Tri sobre su similar de Brasil, en un partido amistoso celebrado en 1968, en el mítico estadio del Maracaná; Pelé vio actividad en aquel cotejo.
Finalmente, tras su retiro, Javier volvió a vestir los colores azulcremas de manera simbólica en un homenaje encabezado por el Club América, previo a un duelo contra Querétaro en enero de 2013.
